研究发现表观遗传学标记能调控抑癌基因的表达【463.com】

美表观遗传论文作者遭炮轰

研究发现表观遗传学标记能调控抑癌基因的表达
来自洛克菲勒大学,美国NIH癌症研究院等处的研究人员发表了题为H3K4me3
Interactions with TAF3 Regulate Preinitiation Complex Assembly and
Selective Gene
Activation的文章,发现一种重要的表观遗传学标记能调控著名抑癌基因p53特异性靶基因的表达,由此指出了一种癌症表观遗传作用新机制,相关成果公布在《细胞》杂志上。领导这一研究的是著名的基因转录调控研究专家,洛克菲勒大学终身教授,美国科学院院士,拉斯克奖获得者Robert
G.Roeder博士。Roeder教授发表的文章至今已逾400余篇,他曾发现了3种负责读取即转录基因的RNA聚合酶,并揭示了转录非同寻常的复杂性。在
基础分子生物学教材中,只要提到真核基因转录,所引用的参考文献许多出自于Roeder教授实验室,他是真核生物基因转录调控方面的顶尖专家。随着研究的深入,科学家发现DNA序列不是唯一的遗传信息,除了基因组DNA外,还有大量遗传学信息调控着基因的表达,称之为表观遗传信息。通过组蛋白氨基末端残基的翻译后修饰对染色体结构和基因转录进行调控,是目前表观遗传学研究领域的重要部分。组蛋白修饰是发生在染色体组成成分–组蛋白上的修饰,主要有甲基化(me)、乙酰化(Ac)、磷酸化(P)、泛素化,ADP-核糖基化等修饰方
式。其中,组蛋白甲基化修饰比较复杂,可以发生在赖氨酸或是精氨酸上,而且每个修饰位点可以有不同的甲基化修饰状态。根据修饰位点以及修饰状态的不同,甲
基化修饰可以激活或抑制基因转录,从而参与正常生理如个体发育、胚胎干细胞定向分化等过程,同时也参与病理如癌症的形成和发展。其中组蛋白H3赖氨酸4三甲基化(H3K4me3)就是一种重要的组蛋白标记,能通过与起始因子TFIID之类的效应因子相互作用,召集激活基因,
促进转录。在这篇文章中,研究人员证明H3K4me3-TAF3能直接与TFIID相互作用,召集激活基因,而其中一些正是著名抑癌基因p53的靶标。通过深入探索,研究人员还发现H3K4me3能通过刺激前起始复合物PIC组装,增加p53依赖性转录,并且通过与TAF3的相互作用,合作性或非
合作性与TATA
box作用,直接参与PIC形成和转录,此外H3K4me3-TAF3/TFIID相互作用也能对基因毒性应激产生反应,调控p53的选择性功能。这些研究发现均表明了H3K4me3这种表观遗传学元素,能通过与PIC相互作用,快速诱导p53特异性靶基因,这种机制不仅对于研究表观遗传学具有重要意义,而且也有助于分析p53在癌症发生发展中的作用。463.com,更多阅读《细胞》发表论文摘要

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Siddhartha Mukherjee 图片来源:Anna Schori

《纽约客》杂志刊登的一篇有关表观遗传学的文章,由于对基因调节的描述不准确而备受指责。美国哥伦比亚大学医生、癌症研究员Siddhartha
Mukherjee撰写的这篇文章阐述了环境因子如何在不改变DNA序列的前提下改变基因活性。

文章发表后不久,芝加哥大学进化生态学家Jerry
Coyne在博客中指出,这篇文章是“肤浅和具有误导性的”,主要原因是它忽视了基因调节的重要方面。也有研究人员表示,该文章“具有可怕的破坏性”。

Mukherjee则发表文章逐项反驳了质疑。他在接受《自然》杂志采访时指出,他意识到自己的错误在于省略该学科的主要领域,但这并不意味着具有误导性。“我由衷地认为自己的做法是合法的。”他说。

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